L'Eurofighter est avant tout élaboré pour les missions de supériorité aérienne. Son armement consiste dans cette configuration en un canon embarqué de 27 mm de type Mauser, intégré dans l’emplanture de la demi-voilure droite et d’une panoplie de missiles air-air à courte et moyenne portée. L’avion emporte aussi quatre missiles à moyenne portée capables de tirer derrière l’horizon visuel (Beyond Visual Range – BVR), semi-noyés dans le revêtement inférieur du fuselage, l’un derrière l’autre. Pour l’heure, le Meteor ainsi que quatre missiles de type AMRAAM sont proposés. L’équipement standard prévoit en outre deux missiles à courte portée fixés à des points d’emport sous les ailes. Les missiles Sidewinder AIML-9 et Iris-T sont déjà qualifiés. Ils sont également mis en œuvre et approvisionnés par les Forces Aériennes suisses, exception faite du Meteor.
Pour les missions de supériorité aérienne, d’autres missiles air-air peuvent être fixés aux points d’emport sous voilure. Par ailleurs, l'Eurofighter emporte pour ce type de missions jusqu’à trois réservoirs supplémentaires, un sous le fuselage et un autre sous chacune des demi-voilures. Son rayon d’action ou la durée de sa mission s’en trouvent grandement augmentés alors même que de par sa conception et sa motorisation, il n’en résulte quasi aucune perte quant à la poussée.
Un grand choix d’armes pouvant être fixées aux points d’emport sous voilure sont également prévues pour le rôle air-sol ou les profils de mission spéciaux : la bombe à guidage laser (série Paveway) et les missiles antiradars (ALARM), antichars (Brimstone), antisurface (Harpoon) ou de croisière (Storm Shadow, Taurus) ne sont cités ici qu’à titre d’exemples. Cette panoplie d’emports externes est complétée par un dispositif d’acquisition de cible par rayon laser embarqué dans un conteneur.
